标签: scRNA-seq
包含该标签的所有文章 "scRNA-seq".
-
黑色素瘤单细胞深度复现:从 GSE72056 到恶性细胞程序、T 细胞耗竭和肿瘤微环境
基于 Tirosh et al. 黑色素瘤单细胞数据 GSE72056,进一步从作者 revised processed matrix 和注释出发,复核恶性/非恶性标签、肿瘤间组成、MITF/AXL-like 程序、T cell exhaustion 和公开矩阵层面的复现边界。
-
胶质母细胞瘤单细胞异质性复现:从 GSE57872 到患者内肿瘤程序差异
基于Patel et al.经典GBM数据GSE57872,复核430个原发肿瘤单细胞的患者结构和连续肿瘤程序;患者级汇总取代硬标签组成与细胞级总体推断。
-
视网膜双极细胞单细胞数据复现:从 GSE81904 到 rod、ON/OFF 和 cone bipolar 状态
从GSE81904公开双极细胞UMI矩阵抽取6,000个细胞,复核rod、ON、OFF和cone相关连续程序;所有marker-derived identity保持unassigned。
-
DRG 感觉神经元单细胞数据复现:从 GSE59739 到 nociceptor、pruriceptor 和 mechanoreceptor 状态
重新审计 GSE59739 的 799 个公开孔位、原论文 622 个神经元和本次 GMM 中的 591 个 neuron-like 分量细胞,对照 Usoskin 2015 的 11 类与现代 DRG marker taxonomy。
-
小鼠中脑发育单细胞数据复现:从 GSE76381 到 DA neuron 与 progenitor 状态
从 GSE76381 mouse embryo CEF 出发,优先使用作者 Cell_type,分开呈现连续 DA/progenitor program,并明确缺少 embryo/sample ID 的统计边界。
-
远端肺上皮发育数据复现:从 GSE52583 到 AT1/AT2 与 progenitor 状态
从 GSE52583 的单细胞 FPKM tracking 文件出发,核对文件分母、连续肺上皮程序、胚胎级汇总与同矩阵分离 marker 一致性。