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• Tirosh 黑色素瘤深度复现：从 GSE72056 到恶性细胞程序、T 细胞耗竭和肿瘤微环境组成

  2026年6月26日

  基于 Tirosh et al. 黑色素瘤单细胞数据 GSE72056，进一步从作者 revised processed matrix 和注释出发，复核恶性/非恶性标签、肿瘤间组成、MITF/AXL-like 程序、T cell exhaustion 和公开矩阵层面的复现边界。

• 复现Patel et al.胶质母细胞瘤单细胞异质性：患者结构与连续肿瘤程序

  2026年6月24日

  基于Patel et al.经典GBM数据GSE57872，复核430个原发肿瘤单细胞的患者结构和连续肿瘤程序；患者级汇总取代硬标签组成与细胞级总体推断。

• 复现Shekhar et al.视网膜双极细胞数据：ON/OFF连续程序与注释边界

  2026年6月21日

  从GSE81904公开双极细胞UMI矩阵抽取6,000个细胞，复核rod、ON、OFF和cone相关连续程序；所有marker-derived identity保持unassigned。

• 复现 Usoskin 2015 DRG 单细胞数据：11 类如何放进现代感觉神经元分类

  2026年6月20日

  重新审计 GSE59739 的 799 个公开孔位、原论文 622 个神经元和本次 GMM 中的 591 个 neuron-like 分量细胞，对照 Usoskin 2015 的 11 类与现代 DRG marker taxonomy。

• 复现 La Manno et al. 小鼠中脑发育数据：从 GSE76381 到 DA neuron 和 progenitor 状态

  2026年6月18日

  从 GSE76381 mouse embryo CEF 出发，优先使用作者 Cell_type，分开呈现连续 DA/progenitor program，并明确缺少 embryo/sample ID 的统计边界。

• 复现 Treutlein et al. 远端肺上皮发育数据：AT1/AT2 连续程序与胚胎级审计

  2026年6月17日

  从 GSE52583 的单细胞 FPKM tracking 文件出发，核对文件分母、连续肺上皮程序、胚胎级汇总与同矩阵分离 marker 一致性。