标签: 单细胞
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DRG 感觉神经元单细胞数据复现:从 GSE59739 到 nociceptor、pruriceptor 和 mechanoreceptor 状态
重新审计 GSE59739 的 799 个公开孔位、原论文 622 个神经元和本次 GMM 中的 591 个 neuron-like 分量细胞,对照 Usoskin 2015 的 11 类与现代 DRG marker taxonomy。
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小鼠中脑发育单细胞数据复现:从 GSE76381 到 DA neuron 与 progenitor 状态
从 GSE76381 mouse embryo CEF 出发,优先使用作者 Cell_type,分开呈现连续 DA/progenitor program,并明确缺少 embryo/sample ID 的统计边界。
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远端肺上皮发育数据复现:从 GSE52583 到 AT1/AT2 与 progenitor 状态
从 GSE52583 的单细胞 FPKM tracking 文件出发,核对文件分母、连续肺上皮程序、胚胎级汇总与同矩阵分离 marker 一致性。
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IFN-beta PBMC 深度复现:从 GSE96583 到 individual 级干扰素响应
在 Kang et al. GSE96583 PBMC IFN-beta 数据的基础上,对齐作者 batch2 metadata,过滤 singlet,补充 original individual、原文 cell type、CellTypist 注释对照和配对 IFN 响应汇总。
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小鼠 ESC 分化单细胞数据复现:从 GSE65525 到多能性下降与早期分化状态
从 GSE65525 的 6 个 ESC 输入矩阵出发,将 d0 的技术重复嵌套到对应生物样本后汇总连续 pluripotency/differentiation program,并明确后续时间点缺少重复。
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Seq-Well PBMC/MTB 单细胞数据复现:从 GSE92495 到髓系反应图谱
核对 GSE92495 第一方元数据后,重做 4638 个单核细胞来源巨噬细胞的 M. tuberculosis 暴露分析,分开呈现作者 cluster、连续 macrophage/IFN/抗原呈递程序和重复边界。