标签: scRNA-seq

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• 从20.8万个细胞到患者级证据：Kim等LUAD单细胞图谱的严谨复现

  2026年7月27日

  用GSE131907公开post-author-QC UMI矩阵，按样本和患者重新检查LUAD跨部位组成、表达状态、malignant-site差异与RNA expression-CNV边界。

• 从55,737×16,291的processed TPM矩阵到患者级证据：Sade-Feldman黑色素瘤免疫治疗单细胞再分析

  2026年7月26日

  基于GSE120575公开Smart-seq2 processed log2(TPM+1)矩阵，按活检、患者和时点复核黑色素瘤免疫治疗相关T/NK程序，并记录统计与注释边界。

• 复现Vento-Tormo et al.母胎界面单细胞数据：从E-MTAB-6701到decidua、placenta和blood的资源边界

  2026年7月19日

  基于Vento-Tormo et al. Nature 2018/E-MTAB-6701公开experiment design、K45 cluster和marker-gene rank表，审计母胎界面细胞组成、组织来源和解释边界。

• 复现Vieira Braga et al.人肺公开子集：从GSE130148到细胞类型复核和受控数据边界

  2026年7月18日

  基于Vieira Braga et al. Nature Medicine 2019/GSE130148公开counts和barcode-cell type metadata，复核人肺resection/Drop-seq公开子集中的细胞类型、marker证据和数据可得性边界。

• 复现van Galen et al. AML单细胞数据：从GSE116256到白血病层级、正常造血和免疫背景

  2026年7月16日

  基于van Galen et al. Cell 2019/GSE116256公开单细胞数据，复核AML diagnosis和Normal BM中的造血层级、like状态、免疫背景和解释边界。

• 复现Parikh et al. UC结肠上皮单细胞数据：从GSE116222到连续程序与样本边界

  2026年7月15日

  基于Parikh et al. Nature 2019/GSE116222公开表达矩阵，复核9个样本中的结肠上皮连续程序、marker一致性和样本级差异，并明确停止使用最高分硬标签及其组成比例。