标签: 单细胞

包含该标签的所有文章 "单细胞".

• 复现 Baron et al. 人胰腺单细胞图谱：从 GSE84133 到 alpha、beta、ductal 和 acinar 细胞结构

  2026年6月9日

  基于 Baron et al. 经典人胰腺单细胞数据 GSE84133，复现 4 个 human donor、8569 个细胞和 20125 个基因的胰腺细胞图谱，重点解释 alpha、beta、delta、gamma、acinar、ductal、stellate、endothelial 和免疫细胞的 marker 证据、组成差异与复现边界。

• 复现 Habermann et al. 肺纤维化单细胞图谱：从 GSE135893 到 IPF 上皮损伤和纤维化微环境

  2026年6月8日

  基于 Habermann et al. 公开肺纤维化单细胞数据 GSE135893，围绕 11.4 万个已注释细胞复现 IPF、ILD 与对照肺组织中的 epithelial、immune、endothelial 和 mesenchymal 图谱，重点解释 AT2、KRT5-/KRT17+、MUC5B+、macrophage、myofibroblast 和纤维化 ECM 信号。

• 复现 Macosko et al. 经典 Drop-seq 视网膜数据：从 GSE63472 到 P14 retina 细胞图谱

  2026年6月8日

  从 GSE63472 processed logDGE 中固定抽取 8000 个细胞，按 GEO 的 7 个实验样本和 4 个采集日整理连续视网膜 program，并撤掉最高分身份比例。

• 复现 MacParland et al. 人肝脏单细胞图谱：从 GSE115469 到肝细胞、LSEC 和 Kupffer 细胞结构

  2026年6月8日

  基于 MacParland et al. 2018 Nature Communications 人肝脏单细胞数据 GSE115469，复现 8444 个细胞的 hepatocyte、LSEC、portal endothelial、cholangiocyte、macrophage、T/NK/B/plasma 等图谱，并检查肝细胞、内皮和 Kupffer/髓系相关 marker。

• 复现 Haber et al. 小肠上皮单细胞图谱：从 GSE92332 到干细胞-分化谱系

  2026年6月8日

  基于 Haber et al. 2017 Nature 小肠上皮单细胞数据 GSE92332，复现 7216 个小鼠小肠上皮细胞的 Stem、TA、Enterocyte、Goblet、Paneth、Tuft 和 Endocrine 谱系图谱，并用 marker 与 signature 检查细胞身份。

• 复现 Puram et al. 头颈鳞癌单细胞图谱：从 GSE103322 到肿瘤微环境和 p-EMT 信号

  2026年6月8日

  基于 Puram et al. 2017 Cell 头颈鳞癌单细胞数据 GSE103322，复现 5902 个细胞的恶性细胞、成纤维细胞、T 细胞、内皮、B 细胞、巨噬细胞等主要图谱，并检查 p-EMT、T 细胞耗竭和缺氧相关信号。