标签: 单细胞

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• 复现 Zeisel et al. 小鼠脑数据：broad compartment 与 taxonomy 边界

  2026年6月7日

  基于 Zeisel et al. 2015 年 GSE60361 主矩阵，复核 3,005 个细胞的无监督结构、连续脑区室程序、同矩阵 marker 一致性和无 donor/batch 时的解释边界。

• 复现Tabula Muris小鼠脾脏子集：连续免疫程序与小鼠级边界

  2026年6月7日

  基于Tabula Muris GSE109774脾脏SmartSeq2/FACS子集，拼接1,718个单细胞CSV，区分9个cluster、1,704个mapped cells和6只小鼠，并以连续免疫程序取代硬标签组成。

• 复现 Villani et al. 血液 DC/单核细胞图谱：18 个 cluster 与连续免疫程序

  2026年6月7日

  基于 Villani et al. 2017 年 GSE94820 两个公开表达矩阵，复核 2,294 个细胞的无监督结构、FACS gate 来源、连续 DC/单核细胞程序和同矩阵 marker 一致性。

• 复现 Muraro et al. 人胰腺单细胞图谱：从 GSE85241 到 alpha/beta 细胞 marker 验证

  2026年6月7日

  基于 GSE85241 的 4 位供体 processed UMI 矩阵，分开呈现 Leiden、供体结构、连续胰腺 program 和留出 marker；撤掉无 margin 的 cluster 身份计数与比例。

• 复现 Tirosh et al. 黑色素瘤单细胞数据：从 GSE72056 到肿瘤微环境图谱

  2026年6月7日

  基于 Tirosh et al. 2016 Science 经典黑色素瘤单细胞数据 GSE72056，复现恶性细胞、T 细胞、B 细胞、巨噬细胞、CAF、内皮细胞和 NK 细胞组成，并对 MITF/AXL 状态与 T 细胞耗竭信号进行图谱化解读。

• 复现 Kang et al. 的 IFN-beta PBMC 单细胞数据：从公开 GEO 到免疫响应图谱

  2026年6月7日

  从公开 GEO 数据 GSE96583 出发，复现 Kang et al. 经典 PBMC IFN-beta 刺激单细胞数据，展示质控、UMAP、细胞注释、IFN marker、响应评分和与原始文献的对照解读。