标签: 单细胞

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• Villani 血液 DC/monocyte 深度复现：FACS gate 与连续表达程序

  2026年6月27日

  基于 Villani et al. GSE94820 两个公开表达矩阵，比较 FACS gate 与 set 层面的连续程序、观察细胞数和同矩阵分离 marker 一致性，明确 donor 缺失时的解释边界。

• Tirosh 黑色素瘤深度复现：从 GSE72056 到恶性细胞程序、T 细胞耗竭和肿瘤微环境组成

  2026年6月26日

  基于 Tirosh et al. 黑色素瘤单细胞数据 GSE72056，进一步从作者 revised processed matrix 和注释出发，复核恶性/非恶性标签、肿瘤间组成、MITF/AXL-like 程序、T cell exhaustion 和公开矩阵层面的复现边界。

• 复现Patel et al.胶质母细胞瘤单细胞异质性：患者结构与连续肿瘤程序

  2026年6月24日

  基于Patel et al.经典GBM数据GSE57872，复核430个原发肿瘤单细胞的患者结构和连续肿瘤程序；患者级汇总取代硬标签组成与细胞级总体推断。

• 复现 Trapnell et al. 肌母细胞分化单细胞数据：从公开 FPKM 矩阵到 T0/T24/T48/T72 时间结构

  2026年6月23日

  从 GSE52529 的公开 FPKM 矩阵出发，复现 Trapnell et al. 肌母细胞分化中的时间结构、PC1 分化轴和表达梯度。

• 复现 Moignard 造血发育：42 基因 qRT-PCR 能支持什么？

  2026年6月22日

  基于 3934 个细胞的单细胞 qRT-PCR normalized dCt 数据，重新定义未检出下限、panel signal 和连续造血程序，保留作者实验组与重复边界。

• 复现Shekhar et al.视网膜双极细胞数据：ON/OFF连续程序与注释边界

  2026年6月21日

  从GSE81904公开双极细胞UMI矩阵抽取6,000个细胞，复核rod、ON、OFF和cone相关连续程序；所有marker-derived identity保持unassigned。