标签: 神经科学

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• 复现 Gokce et al. 小鼠纹状体单细胞分类：从 GSE82187 到神经元、胶质和采样协议边界

  2026年7月3日

  基于 Gokce et al. GSE82187 公开 log10 CPM 矩阵，复现小鼠纹状体 Neuron、Astro、Oligo、OPC、Microglia、Vascular 等细胞类型结构，并解释 protocol、marker 和 taxonomy 层级边界。

• 复现Shekhar et al.视网膜双极细胞数据：ON/OFF连续程序与注释边界

  2026年6月21日

  从GSE81904公开双极细胞UMI矩阵抽取6,000个细胞，复核rod、ON、OFF和cone相关连续程序；所有marker-derived identity保持unassigned。

• 复现 Usoskin 2015 DRG 单细胞数据：11 类如何放进现代感觉神经元分类

  2026年6月20日

  重新审计 GSE59739 的 799 个公开孔位、原论文 622 个神经元和本次 GMM 中的 591 个 neuron-like 分量细胞，对照 Usoskin 2015 的 11 类与现代 DRG marker taxonomy。

• 复现 Tasic et al. 小鼠视觉皮层单细胞图谱：从 GSE71585 到兴奋性、抑制性和胶质细胞分类

  2026年6月13日

  基于 Tasic et al. 公开小鼠视觉皮层单细胞数据 GSE71585，复现 1,749 个作者 QC 通过细胞的 broad type、primary type、marker、signature score 和聚类对照，重点解释 glutamatergic、GABAergic、astrocyte、oligodendrocyte、OPC、microglia 和 endothelial 结构。

• 复现 Darmanis et al. 人脑单细胞图谱：从 GSE67835 到神经元、胶质和血管细胞谱系

  2026年6月11日

  基于 Darmanis et al. 公开人脑单细胞数据 GSE67835，复现 466 个人脑细胞的表达图谱，重点检查 neurons、astrocytes、oligodendrocytes、OPC、microglia、endothelial 以及 fetal-like/replicating 类群的 marker 支撑和复现边界。

• 复现 Zeisel et al. 小鼠脑数据：broad compartment 与 taxonomy 边界

  2026年6月7日

  基于 Zeisel et al. 2015 年 GSE60361 主矩阵，复核 3,005 个细胞的无监督结构、连续脑区室程序、同矩阵 marker 一致性和无 donor/batch 时的解释边界。