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• 复现 Haber et al. 小肠上皮单细胞图谱：从 GSE92332 到干细胞-分化谱系

  2026年6月8日

  基于 Haber et al. 2017 Nature 小肠上皮单细胞数据 GSE92332，复现 7216 个小鼠小肠上皮细胞的 Stem、TA、Enterocyte、Goblet、Paneth、Tuft 和 Endocrine 谱系图谱，并用 marker 与 signature 检查细胞身份。

• 复现 Puram et al. 头颈鳞癌单细胞图谱：从 GSE103322 到肿瘤微环境和 p-EMT 信号

  2026年6月8日

  基于 Puram et al. 2017 Cell 头颈鳞癌单细胞数据 GSE103322，复现 5902 个细胞的恶性细胞、成纤维细胞、T 细胞、内皮、B 细胞、巨噬细胞等主要图谱，并检查 p-EMT、T 细胞耗竭和缺氧相关信号。

• 复现 Zeisel et al. 小鼠脑数据：broad compartment 与 taxonomy 边界

  2026年6月7日

  基于 Zeisel et al. 2015 年 GSE60361 主矩阵，复核 3,005 个细胞的无监督结构、连续脑区室程序、同矩阵 marker 一致性和无 donor/batch 时的解释边界。

• 复现Tabula Muris小鼠脾脏子集：连续免疫程序与小鼠级边界

  2026年6月7日

  基于Tabula Muris GSE109774脾脏SmartSeq2/FACS子集，拼接1,718个单细胞CSV，区分9个cluster、1,704个mapped cells和6只小鼠，并以连续免疫程序取代硬标签组成。

• 复现 Villani et al. 血液 DC/单核细胞图谱：18 个 cluster 与连续免疫程序

  2026年6月7日

  基于 Villani et al. 2017 年 GSE94820 两个公开表达矩阵，复核 2,294 个细胞的无监督结构、FACS gate 来源、连续 DC/单核细胞程序和同矩阵 marker 一致性。

• 复现 Muraro et al. 人胰腺单细胞图谱：从 GSE85241 到 alpha/beta 细胞 marker 验证

  2026年6月7日

  基于 GSE85241 的 4 位供体 processed UMI 矩阵，分开呈现 Leiden、供体结构、连续胰腺 program 和留出 marker；撤掉无 margin 的 cluster 身份计数与比例。