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生物信息分析笔记
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单细胞 RNA-seq 分析流程测试记录

单细胞质控概览

这是一篇用于测试博客图文排版的公开文章,示例内容包括质控、降维、聚类、注释和结果展示。

1. 质控与标准化

常见质控指标包括细胞总 reads 数、检测到的基因数、线粒体基因比例,以及异常细胞过滤阈值。正式文章中可以记录每个项目使用的阈值、过滤前后细胞数量和主要质量控制图。

2. 降维、聚类与注释

典型流程为 PCA → UMAP/t-SNE → Leiden/Louvain 聚类 → marker gene 注释。文章可以展示 marker 基因、细胞类型比例、组间差异和关键细胞群变化。

通路富集分析流程

3. 结果整理

后续可以在这里发布可公开的分析方法、图表解读和复用脚本说明。客户私有数据和报告不会放在公开博客中。


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